本题考察的是结构化设计工具与面向对象设计工具的区别。
A选项 盒图：是结构化设计中常用的图形工具，用于表示模块及其调用关系，正确属于结构化设计工具。
B选项 HIPO 图：HIPO（Hierarchy plus Input-Process-Output）图是结构化设计的分层输入-处理-输出图，用于展示系统分解结构和功能流程，正确属于结构化设计工具。
C选项 顺序图：顺序图（Sequence Diagram）是 UML 中的面向对象设计工具，用于表示对象之间按时间顺序发送消息的交互过程，不属于结构化设计工具，正确答案。
D选项 程序流程图：用于描述程序执行的控制流程，是结构化设计中经典的流程表示工具，正确属于结构化设计工具。
因此选择 C。