本题考察的是指令寻址方式的基本概念。
A选项主存单元：寄存器间接寻址方式中，寄存器中存放的不是操作数本身，而是操作数在内存中的地址，因此操作数最终存放在主存单元中，这与题干相符，是正确答案。
B选项程序计数器：程序计数器（PC）用来存放下一条要执行指令的地址，与操作数存放位置无关，因此错误。
C选项通用寄存器：寄存器间接寻址方式下，寄存器存放的是操作数的地址，而不是操作数本身，因此错误。
D选项外部存储单元：外部存储（如磁盘）不是寄存器间接寻址的访问范围，通常操作数存放在主存中，外部存储访问属于 I/O 操作，因此错误。
因此，本题正确答案是 A. 主存单元。