本题考察的是系统应用集成（EAI） 的相关概念与服务层次。
此外，互操作性是EAI实现系统交互的关键能力，但并非核心原则，而排他性与EAI的协同集成理念相悖，不属于其基本原则范畴。系统应用集成（EAI）以搭建统一标准平台为核心，实现多应用系统间的数据与功能共享，其核心原则之一是保障各应用程序的独立性，使各系统既能独立运行，又能通过集成平台协同工作，有效提升系统的灵活性与可扩展性。
本小问答案是 独立性。题干中的“系统应用集成构建统一标准的基础平台，在各个应用系统的接口之间共享数据和功能，基本原则是保证应用程序的独立性”对应独立性。
因此，选项 A 正确。