本题考察的是著作权法中关于修改权与署名权的法律保护。
A选项尚不构成侵权：错误。即使 A 公司购买了软件的源程序，也只是获得了使用权或有限的财产权利，并不意味着获得了修改软件并以自己名义发布的全部权利。特别是在没有获得著作权人明确授权的情况下进行修改和再发布，属于侵犯著作人身权中的“修改权”和“署名权”。
B选项侵犯了著作权：正确。著作权包括著作人身权（如署名权、修改权、保护作品完整权）和著作财产权（如复制权、发行权等）。A 公司在未经许可的情况下修改源代码并以自己名义销售，侵犯了原作者的署名权和修改权，因此构成对著作权的侵犯。
C选项侵犯了专利权：错误。专利权是对技术方案的保护，软件若无单独的专利注册，不构成专利权的侵权，本题情境与专利无关。
D选项属于不正当竞争：错误。不正当竞争主要适用于商业行为如仿冒、虚假宣传、商业秘密盗用等情形，而本题核心问题是著作权的侵权，不适用于不正当竞争法范畴。
因此，选项 B 正确。