本题考察的是软件文档分类中用户文档与系统文档的区别。
用户文档面向终端用户与操作员，内容涵盖安装手册、使用说明书、参考手册、版本说明、常见问题解答等，核心作用是指导用户完成软件安装、日常操作，以及了解软件版本更新内容，辅助用户高效使用软件。系统文档则面向软件开发与维护人员，包含从需求分析、系统设计、编码实现到测试部署全流程的相关文档，用于支撑开发人员对系统的理解，以及后续的维护、迭代工作，像系统设计这类涉及系统架构、模块划分的内容就属于系统文档范畴，并不归属于用户文档。
本小问答案是 系统设计。题干中的“系统设计不属于用户文档包括的内容”对应系统设计。
因此，选项 A 正确。