本题考察的是嵌入式系统调试接口的基本概念。
与之区分的是，PCI接口为高速外设总线接口，主要作用是扩展硬件设备。USB接口主打外设连接与数据传输，仅能通过转接方式间接支持调试，本身并非专用调试接口。网络接口以通信功能为核心，虽可实现远程调试，但不属于嵌入式CPU的专用底层调试接口。嵌入式系统中，JTAG接口是CPU调试的常用底层硬件接口，它遵循IEEE 1149.1国际标准，除了调试CPU，还可用于DSP、FPGA等各类嵌入式器件的程序下载与硬件调试。
本小问答案是 JTAG接口。题干中的“在嵌入式系统设计中，用来进行 CPU 调试的常用接口”对应JTAG接口。
因此，选项 D 正确。