本题考察的是我国软件著作权登记管理机构的相关规定。
A选项著作权登记中心：我国并没有该正式机构名称，属于干扰项。错误。
B选项国家知识产权局：主要负责专利、商标等知识产权事务，不负责软件著作权登记。错误。
C选项中国版权保护中心：根据《计算机软件著作权登记办法》第一章第六条，国家版权局认定中国版权保护中心为软件著作权登记机构，并可在地方设立登记办事机构，正确。
D选项国家专利局：该机构主要处理专利相关事务，不涉及著作权登记。错误。
因此，本题答案为 C。