本题考察的是 网络安全体系设计的层次划分。
A选项物理线路安全和网络安全：强调的是通信线路的安全与网络设备的防护，和数据库容灾没有直接关系，错误。
B选项应用安全和网络安全：数据库虽然与应用相关，但容灾主要涉及数据库系统的整体安全保障，并非网络安全范畴，因此错误。
C选项系统安全和网络安全：系统安全涵盖数据库管理系统的稳定性，但数据库容灾与网络安全关系不大，错误。
D选项系统安全和应用安全：数据库属于系统软件的范畴，其容灾保证系统级别的稳定运行；同时数据库中保存的是应用层数据，容灾又确保应用数据的可用性，因此正确。
因此，本题的正确答案是 D。