本题考察的是设计模式的分类，属于系统分析设计的重要知识点。
设计模式通常分为三大类：创建型模式、结构型模式、行为型模式。
A选项 原型（Prototype）和模板方法（Template Method）：
Prototype 是创建型模式，Template Method 是行为型模式，因此两者不属于同一类，错误。
B选项 组合（Composite）和代理（Proxy）：
Composite 和 Proxy 都是结构型模式，分别用于对象树形结构的统一表示和对象访问控制，属于同一类，正确。
C选项 桥接（Bridge）和状态（State）：
Bridge 是结构型模式，State 是行为型模式，不属于同一类，错误。
D选项 外观（Facade）和中介（Mediator）：
Facade 是结构型模式，Mediator 是行为型模式，两者都不是创建型模式，错误。
因此，正确答案为 B. 组合（Composite）和代理（Proxy）属于结构型模式。