本题考察的是数据库三级模式结构中的各个层次作用。
数据库系统的三级模式结构各有明确定位，外模式对应用户视角的数据视图，满足不同用户的个性化数据访问需求。内模式则聚焦数据在存储介质上的物理存储细节，涵盖存储结构、索引组织、记录排列方式等关键物理实现要素。聚簇索引是一类特殊的索引，它会直接调整数据在磁盘等存储介质上的物理存储顺序，让数据按索引键值有序排列，因此对表创建聚簇索引属于对内模式层面的修改。与之相对的非聚簇索引仅维护索引与数据的指向关系，不会改变数据的物理存储布局，仍归属于内模式的范畴但影响范围更有限。
本小问答案是 内模式。题干中的“在采用三级模式结构的数据库系统中，如果对数据库中的表创建聚簇索引，那么改变的是数据库的内模式”对应内模式。
因此，选项 B 正确。