本题考察的是数据库三级模式结构中的各个层次作用。
在数据库系统中，三级模式结构包括：

• 外模式（External Schema）：描述用户看到和使用的数据视图，体现个性化的需求；
• 模式（Conceptual Schema）：描述数据库的全局逻辑结构，如表结构、字段、数据类型及关系；
• 内模式（Internal Schema）：描述数据在存储介质上的物理存储方式，包括数据的存储结构、索引、记录排列方式等。

聚簇索引会影响数据库中数据的物理存储结构，即数据在磁盘上的排列顺序也会按索引排序。因此，它修改的是内模式。
A选项模式：描述逻辑结构，不涉及物理实现，错误
B选项内模式：正确，索引属于物理实现层面
C选项外模式：用户视图层面，未涉及
D选项用户模式：不是标准术语，误导选项
因此，选项 B 正确。