本题考察的是职务作品著作权归属的相关概念。
根据《著作权法》，在执行本单位工作任务或者主要利用本单位的物质技术条件所创作的作品，属于职务作品。
A选项应由公司：正确。王某编写的软件文档是履行公司工作任务的结果，属于职务作品，著作权应归公司所有。
B选项应由公司和王某共同：错误。职务作品的著作权不由个人与单位共同享有。
C选项应自王某：错误。如果是利用业余时间、个人条件独立完成的非职务作品，才属于个人，但本题明显属于职务作品。
D选项除署名权以外，著作权的其他权利由王某：错误。职务作品的署名权归作者本人，但著作权财产权归公司，而非个人。
因此，正确答案是 A。