本题考察的是嵌入式数据库与基于网络的数据库系统的区别。
NDB 是一种通过网络（如 4G/5G）访问远程数据库的架构，客户端负责与嵌入式程序对接，通信协议负责定义与远程服务器交互的规则，服务器端维护实际的数据库数据。
A选项：正确，NDB 架构由客户端、通信协议和远程服务器组成，这符合其基本结构。
B选项：正确，客户端提供访问接口，通信协议用于交互规范，远程服务器进行数据管理，这正是 NDB 的工作分工。
C选项：正确，NDB 的客户端模块轻量化、可裁剪、代码可复用，符合其在嵌入式环境的设计要求。
D选项：错误，该描述是基于文件的数据库系统的特点，而非 NDB。NDB 数据存储在远程服务器的数据库中，客户端不直接操作数据文件。
因此，选项 D 正确。