本题考察的是系统分析阶段的功能建模工具。
系统功能体系图仅用于层次化分解系统功能，展现功能的分解结构，无法体现执行流程与校验功能完整性。系统分析阶段的功能建模工具各有明确应用场景，功能流程图可梳理功能间的逻辑顺序与依赖关系，能校验功能识别的完整性，清晰反映对系统功能的理解，是后续系统设计的重要基础。数据流图侧重描述数据在系统内的流动与加工逻辑，核心聚焦数据处理而非功能流程。实体-联系图则用于刻画数据实体间的关联关系，主要服务于数据库设计环节，与系统功能流程分析无关。
本小问答案是 功能流程图。题干中的“阶段，在确定系统的所有功能后，还需要分析各功能之间的关系和流程，使用功能流程图来检验是否识别出所有的功能，判定系统分析师是否了解系统功能，也是以后进行系统”对应功能流程图。
因此，选项 B 正确。